Один из крупнейших специалистов по языкам и этнографии народностей палеоазиатской группы.

Исследовательскую работу начал в 1926 г., работал на Сахалине учителем нивхской национальной школы и уполномоченным по туземным делам при Сахалинском Окрревкоме. Первая научная работа, посвящённая размещению и составу нерусского населения о. Сахалин, вышла в 1928 г. С 1928 по 1932 гг. Ю.А. Крейнович прошёл курс аспирантуры при ЛГУ, состоя в то же время младшим научным сотрудником Музея антропологии и этнографии АН СССР. С 1932 по 1937 гг. работал в Институте народов Севера в качестве научного сотрудника (с 1935 г. - старшего) и преподавателя нивхского языка. Продолжал публиковать научные работы по языку и этнографии нивхов.

В 1937 г. Ю.А. Крейнович был арестован и в течение десяти лет находился в исправительно-трудовых лагерях. Даже в эти годы он находил возможности для ведения исследовательской работы: им были собраны ценные материалы по юкагирскому и корякскому языкам, а также по арманскому диалекту эвенского языка.

В 1948 г. защитил кандидатскую диссертацию на тему "Грамматика юкагирского языка". В том же 1948 году повторно арестован по доносу и отправлен в ссылку в Красноярский край, где, работая фельдшером, изучал язык и фольклор кетов.

В октябре 1955 г. реабилитирован. С марта 1956 г. работал в Ленинградском отделении Института языкознания АН СССР. Выполнял большую экспедиционно-научную работу, проведя в экспедициях свыше пятнадцати месяцев. В августе 1964 г. Ю.А. Крейнович участвовал в VII Международном конгрессе антропологических и этнографических наук в Москве.

В 1972 г. присуждена степень доктора филологических наук за диссертацию по кетскому языку.