М.В. Русакова работала в отделе теории грамматики с марта 2008 года. В центре внеимания М.В. Русаковой находились проблемы, связанные с психолингвистическим описанием грамматики русского языка и прежде всего с так называемыми трудными случаями русской морфологии. Предлагаемые М.В. Русаковой трактовки морфологических явлений, неоднозначно определяемых в рамках традиционного грамматического описания, базировались на экспериментах, а также на анализе корпуса сбоев, зафиксированных в спонтанной устной речи.

Публикации М.В. Русаковой посвящены взаимоотношениям видовых пар глагола, природе согласования и морфологическому статусу прилагательного, другим вопросам морфологии и словообразования, в частности месту психолингвистических исследований в лингвистике.

М.В. Русакова подготовила следующие программы учебных курсов: "Языковая компетенция и механзмы речевой деятельности в онтогенезе", "Экспериментальная грамматика русского языка", "Отклонения от системы в спонтанной речи: анализ и лингвистические импликации", "Методы и методики современного лингвистического исследования". Три первые программы опубликованы.

Являлась участницей семинара "Интегральное моделирование языка" (СПбГУ). Выступала в качестве рецензента диссертационных и монографических исследований.

С 1993 года являлась организатором и председателем жюри Городской олимпиады по русскому языку, готовила петербургскую команду школьников для участия в Российской и международных олимпиадах по русскому языку.