На базе Института лингвистических исследований работает совет по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук 24.1.072.01. Совет принимает к защите работы по следующим специальностям:
- 5.9.5 — Русский язык. Языки народов России (филологические науки)
- 5.9.8 — Теоретическая, прикладная и сравнительно-сопоставительная лингвистика (филологические науки).